Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms