Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms