Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC175P0C221 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms