Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLA1P09884 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLA1P09884 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLA1P09884 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLA1P09884 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLA1P09884 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLA1P09884 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLA1P09884 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLA1P09884 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLA1P09884 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms