Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOP08100 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOP08100 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOP08100 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOP08100 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOP08100 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOP08100 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOP08100 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms