Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAVP06756 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms