Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCAP01258 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCAP01258 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCAP01258 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCAP01258 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCAP01258 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCAP01258 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms