Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms