Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms