Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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