Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms