Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms