Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms