Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms