Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms