Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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KCNIP3Q9Y2W7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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KCNIP3Q9Y2W7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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KCNIP3Q9Y2W7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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KCNIP3Q9Y2W7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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KCNIP3Q9Y2W7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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KCNIP3Q9Y2W7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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KCNIP3Q9Y2W7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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