Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms