Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MBD1Q9UIS9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms