Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms