Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms