Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XPR1Q9UBH6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPR1Q9UBH6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms