Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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