Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPIFA1Q9NP55 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms