Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM38AQ9H6F2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM38AQ9H6F2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM38AQ9H6F2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM38AQ9H6F2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM38AQ9H6F2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM38AQ9H6F2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM38AQ9H6F2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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