Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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