Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms