Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNPPD1Q9BV87 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms