Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms