Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms