Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf43Q9BQ61 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms