Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOPXQ9BPY8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOPXQ9BPY8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOPXQ9BPY8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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