Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms