Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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