Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms