Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms