Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GCN1Q92616 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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GCN1Q92616 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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GCN1Q92616 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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GCN1Q92616 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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GCN1Q92616 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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GCN1Q92616 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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