Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATL1Q8WXF7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms