Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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