Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHPFQ8IZ52 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHPFQ8IZ52 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHPFQ8IZ52 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHPFQ8IZ52 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHPFQ8IZ52 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHPFQ8IZ52 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms