Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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