Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms