Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q7L0L9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q7L0L9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q7L0L9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q7L0L9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q7L0L9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q7L0L9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q7L0L9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms