Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms