Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB2Q6NT52 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms