Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms