Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms