Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms