Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms