Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms