Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms